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复合碳源专门应用于污水处理系统中，以解决碳源不足而导致的出水NOx-N偏高问题，提高污水处理系统的反硝化能力，同时对强化生物除磷也有很好的效果。该产品通常用于缺氧池，反硝化滤池等缺氧区域，也可用于为厌氧反应器或者好氧反应器提供碳源。
复合碳源应用于城市及城镇等市政生活污水微生物处理中及屠宰、本地制革、本地食品、本地电镀等工业废水处理中。目前市场上常用的碳源包括甲醇、本地醋酸、本地乙酸钠、本地面粉、本地葡萄糖、本地生物质碳源、本地污泥水解上清液、本地啤酒废水和垃圾渗滤液等。在应用过程中，需要根据实际工程情况选择合适的碳源。
节微生物群落结构通过添加碳源，可以调整污水系统中的微生物群落结构，优化微生物的代谢途径。在污水环境中，存在着多种多样的微生物菌群，不同的菌群对碳源的利用效率和方式各有不同。当添加特定的碳源时，那些能够利用该碳源的微生物菌群就会相对优势生长。例如，在一个同时含有氨氮和有机污染物的污水环境中，如果投加了易于被反硝化细菌利用的碳源，那么反硝化细菌的生长就可能得到促进，进而在微生物群落中的比例升高。这种对微生物群落结构的调控可以实现更加、当地更符合环保要求的污水处理过程，例如提高污水中氮磷的去除效果，因为特定的微生物菌群往往在氮磷的代谢转化方面具有特定的功能。同时，这种调节也有助于恢复在污水处理过程中受到抑制或者失衡的微生物群落，维持系统内微生物生态的稳定和多样性。
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